Compound Discoverer 3.0助力代谢流研究

2019-11-07 18:04 来源:未知

定性代谢流面临多种挑战,在原始数据采集上,不可避免面临同位素异数体的共流出、以及因标记同位素不同取代程度引起的跨度较大的丰度范围,因此需要高分辨质谱平台来实现同位素的测量准度和精度以及宽动态范围;数据处理上,便捷、完整、高效以及生物途径可视化的处理软件是必需装备。

来自 Seahorse 团队的产品经理张小宇则着重从能量代谢角度做了《从能量角度看细胞:新的视角,独到的精彩》的报告。Seahorse 细胞能量代谢平台,可通过监测细胞的体内糖酵解/线粒体呼吸引起的胞外酸化速率、氧气消耗速率来判定不同状态下的细胞实时代谢状态,佐证代谢理论,方便、快捷地帮助研究者进行不同疾病能量代谢通路与细胞功能的关联研究。

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代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统生物学的重要组成部分。安捷伦在代谢组学方面积累了丰富的检测技术和解决方案。

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Agilent 的整体解决方案,将包括生物标志物的发现、鉴定、靶向验证以及通路分析过程中所需要的硬件、软件、消耗品及服务支持的整体融入到代谢组学综合解决方案中,为开启代谢组学的精准研究,提供了有力的条件。

系统生物学由代谢组学与基因组学、转录组学和蛋白质组学组成。作为上述一系列微小变化的组学事件最终放大结果,研究目标为最下游代谢物的代谢组学更能直观地反应生物体系的状态,因此吸引众多科研工作者投身其中,乐此不疲。

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但生物体系的代谢物是流动的,代谢流的目的是阐述生物体内代谢网络的一个时间依赖的变化过程,机体的代谢网络循环遵循物质守恒定律,某个代谢物增加的来源可能有两种,上游产量增加或下游消耗降低。

安捷伦液质联用产品应用经理冉小蓉博士为大家带来了题为《开启深度研究,洞悉机理机制—代谢组学、代谢流与 Seahorse 的前沿整合方案》的报告,向大家介绍了安捷伦拓展代谢组学深度研究的前沿解决方案。安捷伦基于 MPP 的非靶向/靶向代谢组学工作流程有效地发现差异代谢物,并匹配可能激活的通路;基于 VistaFlux 的定性代谢流解决方案提供更快、更准、更完整的差异代谢物在通路上动态活动规律的研究;Seahorse 在活细胞水平上的细胞能量代谢分析,实现对组学/代谢流结果的正交生物学验证。安捷伦这三个方案的整合,无疑实现了对一个复杂生物学问题从生物标记物的发现到机理机制深入阐释的多维度的动态研究。

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